日本原子能機構計劃在未來60～70年關閉日本89個核設施中的79個，包括研究堆和測試大樓。日本原子能機構估計，位于茨城縣的東海乏燃料后處理廠的退役費用將達到71.9億美元，如果加上處理高放廢液的費用，最終費用將接近93.3億美元。

日本原子能機構稱“文殊”快堆的退役費用為14億美元。不過，退役過程預計將持續30年，如果加上此間維護費用，“文殊”快堆的退役費用將增至35億美元。

根據日本原子能機構新的預算計劃，44個設施的退役工作將在2028財年同時開始。然而，日本原子能機構目前還沒有針對核設施中庫存钚的管理計劃，也尚未決定如何處理79個核設施的放射性廢物。